曹晖教授在中医药文化传承、中药资源评价与炮制规范、中药现代化科技产业管理、工程技术与新产品开发等方面均有所建树，对中药现代化作出了杰出贡献。

（1）先后主持多项大型本草文献、中医药文化传承工作，如主编出版《本草品汇精要》（北京科学技术出版社，2019）、《“一带一路”中医药文物图谱集》（暨南大学出版社，2016）、《中国药学文物图集》（暨南大学出版社，2017），参与《中国医史博物馆文物选粹》（中国书店，1988）、《中华本草》（上海科学技术出版社，1998）、《中国本草全书》（华夏出版社，2000-2003）、《中华大典·医药卫生典·药学分典》（四川出版集团·巴蜀书社，2007）、《图说中医学史》（广西科学技术出版社，2010）、《本草纲目研究集成》（科学出版社，2018-2020）等编撰工作。“明代药典《本草品汇精要》整理研究”获2009中华中医药学会科技二等奖。

（2）作为中药分子鉴定学科带头人，在国内率先开展中药分子鉴定新技术研究，是该领域的早期开拓者之一。自1991年以来开展三七、人参、甘草、黄芪、党参、半夏、蕲蛇及岭南特色资源鱼鳔、广藿香、广地龙、凉茶原料等200余个药材DNA分子鉴定的研究。发表中药分子鉴定学论文和出版专著50余篇（部），先后3次荣获科技部中国新医药博士论坛、中国药学会学术年会、岛津杯第五届全国药物分析等优秀论文奖。主编《中药分子鉴定》（复旦大学出版社，2004）和《中药分子鉴定技术与应用》（人民卫生出版社，2016）两部专著。其中《中药分子鉴定技术与应用》一书荣获2019年度中华中医药学会学术著作二等奖。“中药分子鉴定技术的开发与推广应用成果”荣获2020年度中华中医药学会科学技术奖二等奖。1995年夏出席在北京召开的第二届中国科协青年科学家会议，受到党和国家领导人江泽民、胡锦涛、朱光亚、周光召等同志的接见。

（3）作为第二批全国名老中医药专家学术经验继承人和第六批全国名老中医药专家学术经验继承指导老师，带暨南大学和广东药科大学2名师承制徒弟。开展继承整理古今中药炮制传统工艺及文献，阐明中药炮制原理，改进传统炮制技术，制定饮片的质量标准等。发表论文30余篇，出版学术专著10余部，包括《全国中药炮制经验与规范集成》（增修本）（北京科学技术出版社，2017）、《炮炙大法点评》（中国医药科技出版社，2018）、《常用中药饮片炮制规范及操作规程研究》（中国医药科技出版社，2019）。正在组织团队编写《中药采制与炮制技术传承集要》系列专著（第一集·毒性中药，第二集·常用大宗中药，第三集·海洋中药）和《中国古法制药技艺图萃》。其中，《中药炮制传统技艺图典》一书荣获2016年度中华中医药学会学术著作奖二等奖。作为国家饮片标准工作组组长，组织全国炮制产学研合作完成《中国药典》2020 年版 300 余饮片标准制修订工作。

（4）基于岭南地区最具特色的道地药材及炮制技艺广泛应用，提出岭南粤帮炮制之“蒸制降燥论”。先后出版《香港市售药材图录—花类篇、果类篇》（商务印书馆（香港）有限公司，2003-2004）、《中国传统道地药材图典》（中国中医药出版社，2017）、《岭南道地药材与外来药物图萃》（暨南大学出版社，2020），编写《粤八味-广东省首批保护道地药材》《岭南特色炮制技艺与现代研究》《中国传统药食两用图典》等专著。主持的“道地药材广地龙加工炮制的虚拟仿真实验教学项目”获得2018年教育部首批国家示范性虚拟仿真实验教学项目及2020首批国家一流本科课程和广东省一流本科课程。

（5）基于留学和国际学术交流期间，非常认同欧美、日本、香港在“执业药剂师”的药学服务培训和生产质量管理规范领域的严格门槛，回国后一直倡议推行相关工作，提出了“借鉴国外经验，推行我国执业中药师资格制度”建议，成为中国执业中药师这个考试制度创始人之一。1996年6月在国家中医药管理局科教司工作期间，负责筹备中国执业中药师资格考试工作，组织编写考试大纲、考试辅导资料，如《全国执业中药师资格考试应试指南》（中药法规汇编、中药实用知识与技能）。在行业报刊如《健康报》、《中药事业报》、《中国医药报》和《中医药管理》杂志上发表了 13 篇有关考试政策和国外药师考试经验的文章，为推动我国执业药师资格考试制度作出了开创性贡献。作为主审与他人合作编写了我国第一本高等医药院校教材《中药药事管理学》（山东泰山出版社，1997年），这本书至今已经成为相关领域的经典必读教科书。

（6）在对中药产业的三大支柱产业进行多次实地考察之后，针对中药产业三大支柱呈现出典型的哑铃型结构（即上游中药材和下游中成药产业与中游中药饮片产业的发展存在着极其不平衡的关系，严重制约着中药现代化工程的整体实现）及中药产地加工与炮制生产相互脱节所导致的饮片生产效率及产品质量难以保障等问题，提出“鲜药炮制论（产地加工炮制一体化论）”，旨在改变中药材田间地头零散加工现状，保障生产环境洁净化，减少加工重复环节，规范饮片生产和管理，全面提升机械化生产和饮片质量。撰写的“中药材采制与饮片炮制产业”和“我国中药产业管理体制的变迁与药材按照药品进行管理的思考”二篇论文分别获得2008和2010年中国商品学会优秀论文一等奖、二等奖。1997年3月在国家中医药管理局质量司工作期间，提出实施《中药炮制生产管理规范》（Good Processing Practice, GPP），希望在道地药材GAP基地，运用已阐明合宜的炮制生产工艺参数、饮片质量标准与规格、养护条件与储藏期限及包装标准等，实施中药饮片定点规范生产、批准文号制度，实现中药饮片规范化生产。作为我国中药饮片GMP设施认证奠基人之一，参与中国中药协会起草编订出版我国首部《中药GMP实施手册》（中央广播电视大学出版社，2001）。2006年承担国家十一五科技支撑计划“中医药标准规范技术体系研究(中药部分)：中药生产管理规范的研究-完善中药饮片生产质量管理规范、实施办法、认证标准”和“符合中药特点的质量标准体系研究-全国饮片炮制标准制定的技术指导原则的制定”课题，对国家实施中药饮片GMP工作起了积极推动作用。

（7）2001年主持国家中药现代化工程技术研究中心工作和 2015 年到暨南大学药学院以来，重点转移到中药现代化科技产业管理和技术推广及新产品开发、名优产品二次开发、教学等领域，主持承担了国家科技部、发改委、工信部、国家市场总局、广东省、珠海市科技产业化项目 50 余项，先后获得省部级科技奖励 20 余次。首先将具有自主知识产权的核心技术“中药双超技术”（中药超声波提取技术和中药超微粉碎技术）等中药产业化关键共性技术进行全面的行业推广，创造了良好经济效益和社会效益。研发复方五指柑胶囊等中药新药 12 个，获得丽珠牌灵芝软胶囊等保健食品 5 个批文，申请国内外专利80余件（获得授权专利 30 余件），工程技术标准 2 个，指导丽珠集团的名优中药抗病毒颗粒、参芪扶正注射液二次开发创造了巨大的经济效益，建立抗新发传染性病毒、系统生物学技术平台具有良好的社会效益。其中承担国家 863 项目“建立功能基因组与生物芯片创新技术平台开发新药产品”获得 2006 年深圳科技创新奖；“超声波强化中药材提取装置的研究”获 2009 年度广东省科学技术进步奖三等奖；“中药生产共性关键技术应用示范研究—超微粉碎技术的研究与应用”分别获得 2006 年度珠海市科学技术进步奖三等奖、2008年度广东省科学技术进步奖三等奖、2010 年度中华中医药学会科学技术奖三等奖；“现代中药质量控制工程技术及标准化示范性研究”先后获得 2004 年度珠海市科学技术进步奖二等奖、2005 年度广东省科学技术进步奖三等奖、2007 年度中华中医药学会科学技术奖三等奖；授权中国发明专利“治疗禽流感的中药组合物、制备方法及其用途（ZL 200610001538.X）”先后荣获 2009 年度珠海市首届专利金奖、2011 年度广东省专利金奖和第 13 届中国专利优秀奖；“中药组合物在制备抗71型肠道病毒的药物中的用途（ZL 201110079938.3）”获得第 19 届中国专利优秀奖；“丽珠牌抗病毒颗粒的抗禽流感和新型甲型流感的实验研究”获得 2009 年度珠海市科学技术进步奖二等奖、2010 年度中国中西医结合学会科学技术奖三等奖；“抗病毒颗粒抗新发传染性疾病的技术发明及其应用”项目获得 2013 年度广东省科学技术奖三等奖、2014 年度中华中医药学会科学技术奖一等奖；“中药抗病毒颗粒抗新发病毒性疾病技术发明及应用研究”获得中国发明协会发明创业奖·成果奖一等奖。“中药注射剂产品升级中的重大共性、关键技术研究与产业化”项目获得2014 年度珠海市科学技术进步奖一等奖、2015 年度广东省科学技术进步奖一等奖。“中药大品种（参芪扶正注射液、抗病毒颗粒）产业化关键技术与产学研深度合作开发研究”荣获2016 年中国产学研合作创新成果奖一等奖。以上中药注射剂部分研究成果分别出版了《数字化中药探索》序列专著I-III册、《中药注射剂重大共性关键技术示范研究》（广东科技出版社，2013）、《中药注射剂临床安全性再评价技术指南》（人民卫生出版社，2013）。